Besættelsen fik på mange måder direkte betydning for vores skole. På loftet skjulte søstrene folk på flugt fra nazisterne, bl.a. en lille jødisk pige. Og selv om det efterhånden nok anedes på skolen, var der ingen der sagde noget! Men det værste skete hen imod krigens slutning, hvor vores søsterskole på Frederiksberg, Institut Jeanne d’Arc, blev bombet ved en fejl, i forbindelse med englændernes bombning af Shell-huset. Mange af de overlevende elever, lærere og søstre flyttedes til vores skole. Det er derfor, at anneksbygningen senere blev opført. I vores skolegård står i dag statuen af Jeanne d’Arc, som stod tilbage i ruinerne af den bombede skole.
Det var sidste år (2020) 75 år siden tragedien fandt sted, og en masse var arrangeret i den anledning, men det hele blev aflyst på grund af corona. Læs om hele historien her
Hvert år mindes vi disse begivenheder på ISJ, i år naturligvis meget begrænset, men det vil helt sikkert blive omtalt i historietimen.